Spisu treści:

Jak obliczasz GC?
Jak obliczasz GC?

Wideo: Jak obliczasz GC?

Wideo: Jak obliczasz GC?
Wideo: GC как получать скин 2024, Listopad
Anonim

Co jest GC Zadowolony? GC treść jest zwykle obliczony jako wartość procentowa i czasami nazywana stosunkiem G+C lub GC -stosunek. GC - procent treści to obliczony jako Count(G + C)/Count(A + T + G + C) * 100%.

Warto również wiedzieć, jak znaleźć zawartość GC w sekwencji?

Kroki

  1. Prześledź sekwencję i policz liczbę nukleotydów cytozyny (C) lub guaniny (G).
  2. Podziel liczbę nukleotydów cytozyny i guaniny przez całkowitą liczbę par zasad w sekwencji.

Dodatkowo, jaka jest wysoka zawartość GC? Dziękuję za jasną odpowiedź! Rozumiem, że podczas korzystania z Zawartość GC jako sposób na zaklasyfikowanie bakterii do gromad Firmicute lub Actinobacteria 60% jest punkt odcięcia. Uwzględnia się powyżej 60% wysoki GC a zatem Actinobacteria, a poniżej 60% jest uważany za niski, a zatem Firmicute.

jak obliczyć współczynnik odpowiedzi w GC?

Generał formuła dla współczynnik odpowiedzi dla GC to powierzchnia piku podzielona przez jego stężenie dla składnika chemicznego. W niektórych przypadkach zamiast powierzchni używana jest wysokość szczytu. Krewny współczynnik odpowiedzi (RRF) jest zatem jeden współczynnik odpowiedzi podzielone przez inne.

Co oznacza zawartość GC?

W biologii molekularnej i genetyce, GC - zadowolony (lub guanina-cytozyna zadowolony ) jest procent zasad azotowych w cząsteczce DNA lub RNA, który są albo guanina (G) albo cytozyna (C).

Zalecana: